El Programa de Manejo de la Zona Costanera (PMZC) fue adoptado el 12 de julio de 1978 como elemento costero del Plan de Uso de Terrenos de Puerto Rico. El Departamento de Recursos Naturales y Ambientales (DRNA), a través de la Oficina del Programa de Zona Costanera y Cambios Climáticos, es la agencia líder para la implantación del Programa. Esta tarea se realiza en estrecha coordinación con la Junta de Planificación, agencia gubernamental responsable de administrar el Proceso de Certificación de Compatibilidad Federal con el Programa. Otras entidades como la Junta de Calidad Ambiental, la Oficina de Gerencia de Permisos, el Departamento de Agricultura y el Instituto de Cultura Puertorriqueña, así como los municipios costeros, poseen responsabilidades de manejo de la costa y sus recursos marinos y costeros. Los fondos de implantación de PMZC provienen de dos fuentes principales: una aportación federal canalizada a través de la Administración Nacional Oceánica y Atmosférica (NOAA) y un pareo estatal proporcionado por el DRNA. Las actividades de implantación se realizan a través de proyectos o tareas que se reflejan en el Plan de Trabajo anual aprobado por ambas agencias y desarrollado mediante un enfoque de manejo integral enfocado en la realidad socioeconómica, ecológica y física de Puerto Rico, basándose en procesos de resolución de conflictos y de prácticas innovadoras de planificación apoyadas en la información y tecnología más avanzada disponible, así como la participación de organizaciones no gubernamentales y de la cuidadanía en general.

El ámbito de aplicación o jurisdicción del Programa de Manejo de la Zona Costanera está definido en el Documento del Programa como: una franja de un kilómetro (1 km) tierra adentro, así como distancias adicionales necesarias para incluir sistemas naturales clave de la costa. El componente marino de la zona costanera se extiende tres (3) leguas marinas (9 millas náuticas o 10.35 millas terrestres), el suelo oceánico bajo éstas, así como todas las islas y cayos dentro de las aguas territoriales.

Por otra parte, la Oficina del Programa de Zona Costanera y Cambios Climáticos funciona como Secretaría Ejecutiva del Consejo de Cambios Climáticos de Puerto Rico, participa activamente en la implantación del Programa del Estuario de la Bahía de San Juan, en los trabajos de manejo integral de la cuenca de la Bahía de Guánica, así como en múltiples programas y proyectos relacionados con el desarrollo de iniciativas o programas relacionados con  áreas y recursos costeros a nivel isla. Esta oficina es responsable, además, de coordinar  proyectos del Programa de Arrecifes de Coral, la Junta Interagencial para el Manejo de Playas y el Comité Interagencial para el Control de las Fuentes Dispersas de Contaminación.

Visión y misión

El enfoque del Programa de Manejo de la Zona Costanera se refleja en los principios rectores o componentes principales del Plan:

• Guiar el desarrollo sostenible de los sectores público y privado en la zona costanera.
• Promover el manejo activo de la costa.
• Promover la educación ambiental, la investigación científica y la participación ciudadana en el manejo de los recursos costeros.